Motivo estructural ALPS
El motivo estructural ALPS (por sus siglas en inglés Amphipathic Lipid Packing Sensor) es un motivo estructural de proteínas que fue identificado por primera vez en 2005 en la enzima ARFGAP1 [1] [2] [3] [4]
La curvatura de una bicapa lipídica de fosfolípidos, como por ejemplo la de un liposoma, produce perturbaciones en el empaquetamiento de los lípidos en el lado de la bicapa que tiene la mayor área superficial. Cuanto menos "ordenado" o más laxo sea el empaquetamiento de los lípidos, más reconocido será por estas estructuras.
Los motivos ALPS son porciones de proteínas de 20 a 40 aminoácidos de longitud que poseen importantes colecciones de diferentes tipos de residuos de aminoácidos. Los residuos voluminosos de aminoácidos hidrófobos como la fenilalanina, Leucina y el Triptófano se encuentran presentes cada 3 o 4 posiciones, con muchos aminoácidos polares presentes entremedias, como la glicina, serina o treonina. Los ALPS carecen de estructura en disolución, pero se pliegan en alfa hélice cuando se asocian con una bicapa lipídica, como la de los residuos hidrofóbicos que se insertan entre lípidos como los empaquetados no muy densamente los residuos polares que miran hacia el citoplasma acuoso.
Referencias
editar- ↑ Bigay J.; Casella JF.; Drin G.; Mesmin B.; Antonny B. (July 2005). «ArfGAP1 responds to membrane curvature through the folding of a lipid packing sensor motif». The EMBO Journal 24 (13): 2244-53. PMC 1173154. PMID 15944734. doi:10.1038/sj.emboj.7600714.
- ↑ Drin G, Casella JF, Gautier R, Boehmer T, Schwartz TU, Antonny B (February 2007). «A general amphipathic alpha-helical motif for sensing membrane curvature». Nature Structural & Molecular Biology 14 (2): 138-46. PMID 17220896. S2CID 11377393. doi:10.1038/nsmb1194.
- ↑ Bradshaw, Ralph A.; Stahl, Philip D. (2015). Encyclopedia of Cell Biology (1st edición). Cambridge MA: Academic Press. p. 206. ISBN 978-0123944474.
- ↑ Vanni S, Vamparys L, Gautier R, Drin G, Etchebest C, Fuchs PF, Antonny B (February 2013). «Amphipathic lipid packing sensor motifs: probing bilayer defects with hydrophobic residues». Biophysical Journal 104 (3): 575-84. Bibcode:2013BpJ...104..575V. PMC 3566459. PMID 23442908. doi:10.1016/j.bpj.2012.11.3837.
- ↑ Horchani H, de Saint-Jean M, Barelli H, Antonny B (2014). «Interaction of the Spo20 membrane-sensor motif with phosphatidic acid and other anionic lipids, and influence of the membrane environment». PLOS ONE 9 (11): e113484. Bibcode:2014PLoSO...9k3484H. PMC 4245137. PMID 25426975. doi:10.1371/journal.pone.0113484.