GelGreen

GelGreen
General
Otros nombres	10,10'-(6,22-dioxo-11,14,17-trioxa-7,21-diazaheptacosano-1,27-dil)bis(3,6-bis(dimetilamino)acridin-10-inio) yodato
Fórmula estructural
Fórmula molecular	C56H80I2N8O5
Identificadores
ChemSpider	10032003
PubChem	11857532
	SMILES O=C (NCCCOCCOCCOCCCNC(CCCCC[N+]1=C2C(C=CC(N(C)C)=C2)=CC3=C1C=C(N(C)C)C=C3)=O)CCCCC[N+]4=C5C(C=CC(N(C)C)=C5)=CC6=C4C=C(N(C)C)C=C6.[I-].[I-]
	InChI InChI=1S/C56H78N8O5.2HI/c1-59(2)47-23-19-43-37-44-20-24-48(60(3)4)40-52(44)63(51(43)39-47)29-13-9-11-17-55(65)57-27-15-31-67-33-35-69-36-34-68-32-16-28-58-56(66)18-12-10-14-30-64-53-41-49(61(5)6)25-21-45(53)38-46-22-26-50(62(7)8)42-54(46)64;;/h19-26,37-42H,9-18,27-36H2,1-8H3;2*1H; Key: TWYVVGMYFLAQMU-UHFFFAOYSA-N
Propiedades físicas
Masa molar	1198.43 g/mol g/mol
	Valores en el SI y en condiciones estándar; (25 ℃ y 1 atm), salvo que se indique lo contrario.
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El GelGreen es un intercalante utilizado para teñir ácidos nucleicos en biología molecular para electroforesis en gel de agarosa. GelGreen está estructuralmente relacionado en forma estrecha con el naranja de acridina, y consiste en dos subunidades de naranja de acridina que se puentean mediante un espaciador.^[1] El GelGreen permite teñir dsADN, ssADN o ARN.

Su fluoróforo, y por lo tanto sus propiedades ópticas, son esencialmente idénticas a los de otros compuestos del tipo naranja N-alquilacridina. Cuando se expone a la luz ultravioleta, presenta fluorescencia con un color verdoso que se intensifica fuertemente tras la unión a ADN.^[2] La sustancia se comercializa como una alternativa menos tóxica y más sensible que el intercalante bromuro de etidio. El GelGreen se vende como una solución en DMSO o, más recientemente, en forma acuosa.

Características fisicoquímicas

Característica	Valor
Fuerza por puente de hidrógeno aceptor	9
Fuerza por puente de hidrógeno donador	2
Número de giros	30
Coeficiente de reparto	2.7
Solubilidad (logS (mol/l))	-12.9
Superficie polar (Å ²)	205.1

Referencias

↑ Biotium Inc., ed. (21 de agosto de 2012). «GelRed & GelGreen». Consultado el 4 de diciembre de 2012.
↑ Biotium Inc. (ed.). «GelRed and GelGreen: Environmentally safe and ultra-sensitive nucleic acid gel stains for replacing EtBr». Consultado el 4 de diciembre de 2012.

Véase también

Enlaces externos

GelGreen (en inglés)

Datos: Q5530325

[1] Biotium Inc., ed. (21 de agosto de 2012). «GelRed & GelGreen». Consultado el 4 de diciembre de 2012.

[2] Biotium Inc. (ed.). «GelRed and GelGreen: Environmentally safe and ultra-sensitive nucleic acid gel stains for replacing EtBr». Consultado el 4 de diciembre de 2012.

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