Wikiproyecto:Taxonomía/Fuentes taxonómicas

En esta página se presentan clasificadas y comentadas fuentes apropiadas para ordenar la descripción de la diversidad biológica.

Son en general fuentes de acceso libre a través de Internet (cuyos contenidos no necesariamente son de dominio público), susceptibles de ser empleadas por todos los colaboradores. Algunas sin embargo, pueden ser fuentes escritas o cuyo acceso en línea es limitado, para cuyo uso puede requerirse la colaboración de otros wikipedistas.

Las fuentes se ordenan en dos categorías, referidas respectivamente a los problemas generales de la clasificación y la nomenclatura, y a la descriptiva de los taxones. Éstas últimas se ordenan por grupos taxonómicos mayores. En el futuro deberá existir también una clasificación geográfica.

Normalización

La taxonomía biológica (nomenclatura más clasificación) es seguramente el área de la ciencia donde antes se consagró un esfuerzo de normalización, en parte porque la Biología Sistemática es un terreno en el que el avance sería sencillamente imposible de otra manera.

•  International Code of Botanical Nomenclature.
  • ICBN (St Louis, 2000)
  • ICBN (Tokyo, 1994).
•  International Code of Zoological Nomenclature.
•  Draft BioCode (1997): the prospective international rules for the scientific names of organisms
•  IWGTD. International Working Group on Taxonomic Databases (International Union of Biological Sciences Taxonomic Database Working Group).

Autoridades

• Lista de botánicos por la abreviatura del autor.

Software

Programas y utilidades para examinar información disponible en la red y para elaborar figuras, principalmente árboles.

•  TreeView. Software gratuito para todos los sistemas operativos, incluido Linux. Traza árboles a partir de varios formatos de datos. Puede explotar, por ejemplo, la mayoría de los árboles en [1]. Apropiado para producir figuras.
•  ATV. A Tree Viewer. Una herramienta Java para la visualización de árboles filogenéticos.
•  PHYLIP. Paquete de programas para análisis filogenético que incluye algunos para trazar árboles. Gratuito. Código compilable para Linux/Unix, código y ejecutables para Windows y (aquí) para Macintosh.

Fuentes sistemáticas

Universales

Fuentes sobre diversidad biológica que no están circunscritas a un grupo particular o que abarcan grupos separados.

• Tree of Life. Filogenia de todos los organismos. La fuente más completa y sencilla a la vez para una clasificación actualizada.
• Species lists. Es el primer sitio en que buscar para saber el número de especies descritas en un grupo.
• TreeBASE. A database of phylogenetic knowledge. Es un depósito de árboles filogenéticos y de los datos con que se han elaborado, así como de las referencias bibliográficas de la publicación de los trabajos. La información a la que da acceso es primaria, pero los árboles pueden servir de quía para el estudio del grupo o para su ilustración. Normalmente permite descargar los árboles en formatos que se pueden visualizar con programas gratuitos como TreeView o ATV.
• Entrez Taxonomy Browser. Servicio de la National Library of Medicine (NIH). Como declaran, no son una autoridad taxonómica, pero su página de búsquedas permite una primera aproximación a organismos con importancia médica.
• Sistema DELTA. Se trata de un sistema de descripción formal informatizable, para el que se han desarrollado varias bases de datos. Destaca la de familias de angiospermas.
• Mikko Haaramo's phylogeny archive. Una web personal con miles de árboles filogenéticos e historias nomenclaturales, siempre adecuadamente acompañadas de referencias.
• The NCBI Taxonomy. Recopilación taxónomica de literatura científica, bases de datos y opiniones de expertos.
• The Taxonomicon. Contiene información taxonómica de multitud de fuentes. La información de cada fuente original se conserva intacta para que sirva como referencia histórica.
• Catalogue of Life. Es una base de datos universal de especies. La compilación de 2018 incluye 1,726,521 especies actuales y 54,003 extintas. Es fruto de la colaboración de dos entidades, Species 2000, que es fundamentalmente una federación internacional de bases de datos taxonómicas, y el ITIS (Integrated Taxonomic Information System, que es sobre todo un consorcio de organismos públicos norteamericanos.
• WoRMS - World Register of Marine Species

Virus

• Index of Viruses. International Committee on Taxonomy of Viruses.

Prokaryota

Fuentes de la nomenclatura y clasificación en los dominios Bacteria y Archaea

•  Approved Lists of Bacterial Names. International Journal of Systematic Bacteriolology, 1980, 30, 225-420.
•  List of prokaryotic names with standing in nomenclature.

Eukarya/Protista

Fuentes de nomenclatura y clasificación para los eucariontes basales (protistas), para el origen y relaciones del conjunto de los eucariontes y de los filos eucarióticos.

• Protist Image Data.
• AlgaeBase Información detallada de más de 100.000 taxones, incluidas nomenclatura y distribución.

Animalia

•  PALAEOS. Descripción, filogenia y clasificación de los organismos extintos y recientes, pero especializado en Vertebrata, con un desarrollo menor de Aves y Mammalia que de los otros grupos.
•  FishBase. A Global Information System on Fishes. Página de búsqueda en español.
•  DinoData. Completa página con la descripción y clasificación de todos los taxones conocidos de dinosaurios. Se especifican también cuáles grupos o nombres específicos clásicos han caído en desuso.
•  Fauna Ibérica.
•  Amphibian Species of the World 3.0 Una base de datos consultable rica en información e insustituible en lo relativo a la nomenclatura y a la distribución. Ofrecida por el American Museum of Natural History.
•  Nomina circumscribentia insectorum. Catalogue of Circumscriptional names of Arthropod Taxa. Registro de nombres de taxones mayores de artrópodos, con indicación de los grupos que abarcan, su ubicación taxonómica y la autoridad que los tipificó. (Atención: al índice se accede desde http://www.insecta.bio.pu.ru/z/nom/~~~Cont.htm)
• Nomenclator Zoologicus. Base de datos de nombres de géneros y subgéneros de animales propuestos formalmente desde 1758 (10ª ed. de Systema Naturae) hasta 2004. Es un servicio de la Zoological Society of london.
• Fauna Europaea. Catálogo de la fauna continental y marina de Europa.
• World Spider Catalog. Catálogo de las arañas del mundo, manternido por Norman I. Platnick, con una base de datos (beta) consultable.
• Avibase. The World Bird Database.
• Learn about butterflies Catálogo de las mariposas del mundo.
• Atlas Hymenoptera Catálogo que recoge los insectos del orden Hymenoptera.
• Antwiki. Wiki dedicada a las hormigas alimentada por la contribución de especialistas.
• Antweb. Otra base de datos de hormigas.
• Antmaps.org. Mapas de distribución de hormigas.
• Systema Dipterorum. The BioSystematic Database of World Diptera. Catálogo de las especies de dípteros del mundo.

Fungi

•  Diversity of the Kingdom Fungi: An Interactive Phylogenetic Tree.
•  Página de búsqueda de nombres de hongos, página de búsqueda de nombres de familias, página de búsqueda de nombres de autores de nombres y página de búsqueda bibliográfica en Index Fungorum. Estos recursos forman parte de CABI Bioscience Databases.
•  Clasificación del filum Ascomycota en MYCONET.
•  Cyberliber. An electronic library for Mycology. Página de localización por autor.

Plantae

• International Plant Names Index (IPNI).
• Index Nominum Genericorum Plantarum.
• Index of Botanists. en los Harvard University Herbaria
• Provisional Global Plant Checklist. de la International Organization for Plant Information
• Flora Iberica.
• Programa Anthos. Base de datos de plantas presentes en España.
• Angiosperm Phylogeny Website. Descripciones de familias y órdenes a las que se accede orden a orden, acompañadas por mapas de distribución y cladogramas. Página debida a P. Stevens albergada por el Missouri Botanical Garden.
• The Families of Flowering Plants: Descriptions, Illustrations, Identification, and Information Retrieval. Descripción formalizada pero en lenguaje natural de cada familia de angiospermas, con enumeración de los géneros incluidos.
• Dictionary of Botanical Epithets. Un diccionario con los significados (en inglés) de los epítetos específicos más frecuentes en los nombres de plantas.