Ribonucleasa T1
La ribonucleasa T1 (EC 3.1.27.3) es una endonucleasa que se encuentra en los fungi que rompe moléculas de ARN de cadena simple después de residuos de guanina en su terminal 3'. La forma más estudiada de esta enzima es la versión que se encuentra en el Aspergillus orzyae. Debido a su especificidad por la guanina, se usa frecuentemente para digerir ARN desnaturalizado antes de su secuenciación. Igual que con otras ribonucleasas como la barnasa y la ribonucleasa A, la ribonucleasa T1 es popular para la realización de estudios de plegado.[2]
| Ribonucleasa T1 | ||||
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 Ribonucleasa T1 de Aspergillus oryzae.[1] | ||||
| Estructuras disponibles | ||||
| PDB |
Lista de códigos PDB 1YGW
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| Identificadores | ||||
| Identificadores externos |
Bases de datos de enzimas
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| Número EC | 3.1.27.3 | |||
| Número CAS | 9026-12-4 | |||
| Ortólogos | ||||
| Especies |
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| UniProt |
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| PubMed (Búsqueda) |
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| PMC (Búsqueda) |
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Estructuralmente, la ribonucleasa T1 es una proteína α+β pequeña de 104 aminoácidos con cuatro filamentos antiparalelos de láminas beta que cubren una hélice alfa de casi 5 vueltas. La ribonucleasa T1 tiene dos enlaces disulfuro, Cys2-Cys10 y Cys6-Cys103, el segundo de los cuales contribuye más a la estabilidad de la proteína.[3] La reducción completa de los dos enlaces disulfuro normalmente rompe el plegamiento de la proteína, aunque éste puede ser recuperado con altas concentraciones salinas.[4]
La ribonucleasa T1 tiene también cuatro residuos prolina, dos de los cuales (Pro-39 y Pro-55) tienen isómeros cis de sus enlaces peptídicos X-Pro. Los isómeros no nativos de estas prolinas pueden retardar dramáticamente el plegamiento conformacional[5] a unos 7000 segundos (casi dos horas) a 10 C y pH 5.[6]
Referencias
editar- ↑ PDB 1ygw
- Pfeiffer S, Karimi-Nejad Y, Rüterjans H (1997). «Limits of NMR structure determination using variable target function calculations: ribonuclease T1, a case study». Journal of Molecular Biology 266 (2): 400-423. PMID 9047372. doi:10.1006/jmbi.1996.0784.
- ↑ Pace, CN; Heinemann U; Hahn U; Saenger W (1991). «Ribonuclease T1: Structure, Function, and Stability». Angewandte Cheni, International Edition 30 (4): 343-360. doi:10.1002/anie.199103433.
- ↑ Pace, CN; Grimsley GR; Thomson JA; Barnett BJ (1988). «Conformational stability and activity of ribonuclease T1 with zero, one, and two intact disulfide bonds». Journal of Biological Chemistry 263 (24): 11820-11825. PMID 2457027.
- ↑ Oobatake, M; Takahashi S; Ooi T (1979). «Conformational stability of ribonuclease T1. II. Salt-induced renaturation». Journal of Biochemistry (Tokyo) 86: 65-70.
- ↑ Mayr, LM; Odefey CO; Schutkowski M; Schmid FX (1996). «Kinetic analysis of the unfolding and refolding of ribonuclease T1 by a stopped-flow double-mixing technique». Biochemistry 35 (17): 5550-5561. PMID 8611546. doi:10.1021/bi953035y.
- ↑ Mullins, LS; Pace CN and Raushel FM (1997). «Conformational stability of ribonuclease T1 measured by hydrogen-deuterium exchange». Protein Science 6 (7): 1387-1395. PMC 2143755. PMID 9232639. doi:10.1002/pro.5560060702.
Datos: Q4394321
