Hélice-giro-hélice
En proteínas, la hélice-giro-hélice es uno de los principales motivo de estructura secundaria capaces de unirse al ADN. Se compone de dos hélices α unidas por una breve secuencia lineal de aminoácidos y se encuentra en muchas proteínas que regulan la expresión génica. No debe ser confundida con el dominio hélice-lazo-hélice.
Su descubrimiento se basó en las similitudes entre los genes de Cro, PAC, y el represor λ, que comparten una secuencia de 20-25 aminoácidos que facilita el reconocimiento por el ADN. El reconocimiento y unión a ADN se hace a través de las dos hélices α, un ocupando el motivo N-terminal y la otra el motivo C-terminal. En la mayoría de los casos, como en el represor Cro, la segunda hélice contribuye más al reconocimiento del ADN y, por tanto, es a menudo llamada la "hélice de reconocimiento". Se une al surco mayor del ADN a través de una serie de puentes de hidrógeno e interacciones de van der Waals con las bases expuestas. La otra hélice α estabiliza la interacción entre proteínas y ADN, pero no juega un papel importante en el reconocimiento.
Referencias
editar- Brennan R, Matthews B (Feb de 1989). «The helix-turn-helix DNA binding motif». J. Biol. Chem. 264 (4): 1903-6. PMID 2644244. Archivado desde el original el 27 de junio de 2009. Consultado el 5 de agosto de 2009.
- Matthews B, Ohlendorf D, Anderson W, Takeda Y (1982). «Structure of the DNA-binding region of lac repressor inferred from its homology with cro repressor». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (5): 1428-32. PMID 6951187. doi:10.1073/pnas.79.5.1428.
Enlaces externos
editar- Motivo hélice-giro-hélice tipo represor lambda, en EMBL
- Entrada PDB para ID 1LMB
- Dominio hélice-giro-hélice tipo Cro/C1 Archivado el 30 de mayo de 2020 en Wayback Machine.